Muziejaus gyvūnijos kolekcijoje saugoma apie 547 eksponatus: paukščių, įvairių gyvūnėlių iškamšos, paukščių kiaušiniai, drugelių ir vabalų kolekcijos bei 34 įvairių gyvūnų ragai. Atnaujintoje gyvūnijos ekspozicijoje šiuo metu eksponuojama 176 vnt. kolekcijos eksponatų. Didesnė dalis eksponatų – paukščių ir žvėrelių buvo sumedžioti Šilutės rajono miškuose, kita dalis 1954-1958 m. pirkta Rygos mokslo priemonių parduotuvėje. Dalis eksponatų yra iš H. Šojaus dvaro medžioklės kambario: drugelių ir vabalų kolekcijos, ragai, sukaupti 1924-34 m., barsuko 1925 m., didžiojo apuoko 1926 m. ir laukio 1928 m. iškamšos bei kėdė puošta medžioklės motyvais.

Vienas iš įspūdingiausių eksponatų yra vilko, kurį 1958 m. Šilutės rajono Ožkarčių miške nušovė medžiotojas V. Mickevičius, iškamša.

1996-1999 metais ekspoziciją papildė paukščių ir žvėrelių iškamšos įsigytos iš Ventės rago ornitologijos stoties. Muziejaus darbuotojas H. Bundorfas 1992 m. sukaupė drugelių kolekciją, kurioje yra ir rečiau Lietuvoje sutinkamas drugys – Machaonas.